Bộ môn Khoa học Sức khỏe chú trọng đến việc phát triển các mối quan hệ hợp tác cả trong nước và quốc tế. Bộ môn đã và đang thiết lập mối quan hệ hợp tác chặt chẽ với nhiều tổ chức, viện nghiên cứu, và trường đại học hàng đầu tại Việt Nam, nhằm mục đích tăng cường chất lượng đào tạo và mở rộng các hoạt động nghiên cứu, đặc biệt là trong các lĩnh vực y tế công cộng, dược học, và khoa học sức khỏe nói chung.

Trong nước, Bộ môn đã hợp tác với nhiều bệnh viện lớn và các trung tâm nghiên cứu y tế uy tín như Bệnh viện Đa khoa Thành phố Cần Thơ, Bệnh viện 121, Trường Đại học Y Dược Cần Thơ, và Đại học Y Dược TP.HCM, Trung Tâm Kiểm Nghiệm Thuốc - Thực Phẩm - Mỹ Phẩm Thành phố Cần Thơ,…

Trên phương diện quốc tế, Bộ môn Khoa học Sức khỏe đã thiết lập các mối quan hệ hợp tác với nhiều trường đại học và tổ chức nghiên cứu uy tín trên thế giới, bao gồm các đối tác tại Nhật Bản (Kyoto Institute of Technology, Kyushu University), Hàn Quốc (Seoul National University), Thái Lan (Naresuan University, Khon Kaen University, Chulalongkorn University), Bỉ (KU Leuven), và các quốc gia khác.