Từ ngày thành lập đến nay, Bộ môn Hóa học đã và đang thực hiện nhiều chương trình, dự án nghiên cứu cấp Trường, cấp Bộ. Các chương trình, dự án nghiên cứu một phần gắn liền với các nghiên cứu cơ bản, một phần gắn liền với thực tế sản xuất ở ĐBSCL, góp phần làm cho sản xuất nông nghiệp được bền vững hơn, giảm thiểu ô nhiễm môi trường.

• Các sản phẩm sinh học (nhiên liệu sinh học, chất hoạt động bề mặt sinh học, dầu nhờn sinh học)
• Hóa học các hợp chất tự nhiên
• Tổng hợp hóa dược
• Xây dựng quy trình phân tích hiện đại ứng dụng trong phân tích dược phẩm, thực phẩm,...